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主要區別有，提取不同、制作工序不同、用途不同，具體如下：
一、提取不同
1、小麥淀粉
小麥淀粉是從小麥中提取淀粉 。
2、玉米淀粉
玉米淀粉是從玉米中提取淀粉 。
二、制作工序不同
1、小麥淀粉
是采用發酵法，即將小麥加水浸軟、磨碎后，進行加酸發酵，使包圍在淀粉顆粒周圍的細胞被溶解而淀粉易于分離 。
2、玉米淀粉
是將玉米用0.3%亞硫酸浸漬后，通過破碎、過篩、沉淀、干燥、磨細等工序而制成 。
【玉米淀粉跟小麥淀粉有什么區別 玉米淀粉和小麥淀粉的區別哪個適合?】三、用途不同
1、小麥淀粉
主要應用于食品做增稠劑、膠凝劑、黏結劑、或穩定劑等，也有的用其做淀粉糖（食用糖的一種）工業上應用不多 。
2、玉米淀粉
在中國菜和法國菜里用作增稠劑 。中國菜里的“勾芡”（又稱芡汁），一般就是用玉米淀粉加上水制成的 。
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