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1、低溫保存 。建議放入冰箱保鮮層 。益生菌的活性會隨著溫度升高而提升并進入發酵過程，長時間常溫保存容易造成產品口味變化 。當溫度超過60℃時，益生菌會進入衰亡階段 。因此，益生菌產品最好是在冷藏條件下取出后直接食用，避免高溫加熱 。
2、避光保存 。避免在溫度太高或者直射光下保存，這樣會引起里面活菌過度發酵，口味變酸，效果受影響 。
【保存益生菌的方法 如何保存益生菌】3、注意保質期保存 。益生菌的活性隨著溫度升高會進入發酵過程，長時間保存益生菌會容易造成口感的變化，一定要注意生產日期保質期，一般來說，益生菌食品，保質期在1個月內，冷藏溫度應控制在2℃-10℃左右 。如果是單獨的益生菌，那么一定要在保質期內吃完 。
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