輪作期限長短一般根據病原物在土壤中存活的期限而定 ， 目的是使那些病原物由于輪作而在土中無適合的食料而逐漸饑餓死亡或大大降低繁殖數量 。例如白術根腐?。‵usarium oxysporium）和地黃枯萎?。‵usarium sp.）輪作期限均為3—5年 。此外 ， 合理選擇輪作物也至關重要 。一般同科、屬植物或同為某些嚴重病、蟲寄主的植物不能選為輪作物 ， 否則不僅不能起到輪作防治病蟲害的目的 ， 反而會起相反作用 。如枸杞、顛茄、泡囊草等都受枸杞負泥蟲嚴重為害；地黃和大豆同為大豆胞囊線蟲的寄主；玄參、附子、白術等同為白絹病等根腐病的寄主 ， 它們都不能選為輪作物 。
對輪作物的選擇原則 ， 從病蟲防治角度同樣適合于間作物的選擇 。但間作物同時栽種在一塊地里 ， 相互之間的影響更大 ， 必須從病蟲害防治和植物的生長發育多方面綜合考慮 。
有些植物的植株和根系分泌物或氣味可以對某些鄰作物病蟲害有抑制或驅避作用 。某些作物因根系的作用 ， 改善了土壤的物理性狀而造成對某些鄰作物根病的不利條件 ， 從而抑制了這些病害的發生；還可能由于高矮作物搭配 ， 對某些鄰作物害蟲活動產生機械的阻礙作用等等 。如果我們科學地運用這些生物之間的微妙關系 ， 就可能選擇較理想的間作物組合 ， 達到防治病蟲害的目的 。實踐表明 ， 根腐病較嚴重的藥用植物和有氣生根的玉米間作 ， 可改善土壤通氣狀況 ， 則根腐病減輕 ， 如附子和玉米間作 ， 附子根腐病則減輕；地黃和高稈作物玉米間作 ， 使地黃蛺蝶為害顯著減輕 ， 這可能是由于成蟲飛翔產卵活動受到機械阻礙作用的緣故 。國外文獻報道 ， 和萬壽菊間作的植物可抑制植物寄生線蟲等 。
2.耕作
深耕細作是重要的栽培措施 ， 除能促進植株根系發育 ， 增強吸收水肥能力使植物生長健壯 ， 增強抗病能力外 ， 還能破壞蟄伏在土內休眠的害蟲巢穴和病菌越冬的場所 。直接消滅病原物和害蟲 ， 減少翌年病蟲基數 。例如大黃擬守瓜（Gellerucida sp.）、山茱萸尺蠖（Boarmia eosoria Leech）、黃梔子大透翅天蛾（Cephonodes hylas L.）、枸杞負泥蟲（Lema decempunctata Scopoli）、栝樓透翅蛾（Melittia bombyliformis Cramer）等以各自特定蟲態在寄主根際土內越冬 ， 因此在冬季或早春耕翻土地或在根際墾覆 ， 破壞害蟲越冬場所或改變棲息環境 ， 直接消滅部分害蟲 ， 減少越冬蟲源 ， 以抑制翌年蟲害發生數量 ， 達到防治目的 。對土傳病害嚴重的藥用植物人參、西洋參等 ， 播種前對土地耕作要求很嚴格 ， 播前除必須休間養地外 ， 還要耕翻曬土數遍 ， 以改善土壤物理性狀 ， 減少土中致病菌數量 ， 這已成為既定的重要防病措施 。
3.除草、修剪及清潔田園
田間雜草及中草藥收獲后病蟲殘株和掉落在田間的枯枝落葉 ， 往往是病蟲隱蔽及越冬場所和翌年的病蟲來源 ， 因此 ， 除草及藥用植物收獲后清潔田園 ， 結合修剪將病蟲殘株和枯枝落葉燒毀或深埋處理 ， 可以大大壓低病蟲越冬基數和翌年病蟲為害程度 。例如枸杞黑果病〔Glomerella cingulata（Stonem）Spanld et Von Schrenk]病原菌是在病株枯枝葉和罹病的僵果上越冬 ， 抓冬季清園工作是主要防病措施 。在秋季收果后 ， 徹底摘除樹上的黑果和剪除病枝 ， 并將地面枯枝落葉和黑果全部清除燒毀或深埋 。翌年7月中旬調查發病率結果表明 ， 清園好的地塊發病率為2.1% ， 清園不好的為22.4% ， 未清園的為50.8% ， 清園收到了良好的防病效果 。
4.調節播種期
某些病蟲害常和中草藥某個生長發育階段有關 ， 如使這一階段錯過病蟲大量侵染為害的危險期 ， 可避開病、蟲為害 ， 達到防治目的 。例如 ， 紅花實蠅在紅花花蕾現白期為大量產卵為害盛期 ， 如實行冬播或春季早播（3月上中旬）可使苗早苗壯 ， 提前現蕾 ， 錯過實蠅產卵盛期 ， 從而減輕其為害 。又如荊芥莖枯?。‵usarium spp.）在浙江蕭山6月上旬為發病盛期 ， 如實行適時早播（4月初前播種） ， 到6月上旬時 ， 苗高在25cm以上 ， 具有一定抗病力 ， 可減輕莖枯病 。
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